Hace muchísimo que no juego al Gothic 2, pero en principio no hay problema, es mas, lo ideal, es hacer todas las misiones que puedas, y con esto digo, todas las misiones necesarias para unirte a cualquiera de las facciones, pero sin unirte, por las recompensas y la experiencia, y ya cuando las tengas todas hechas, decides y te unes a la faccion que tu quieras, las misiones de unirte a las otras facciones se cancelarán al momento de unirte.
Eso si, aunque decidas mas tarde, lo ideal es que tengas en mente, a cual quieres unirte, por la distribución de puntos de habilidad, no gastar todo en fuerza y armas, si lo que quieres es ser mago, porque después te costará mucho remontar.